Master's thesis in Reconstructing methanotrophic bacteria communities during the Holocene of an alpine lake (m/f/d)

Eawag, l'Institut fédéral suisse des sciences et technologies aquatiques, est un institut de recherche aquatique internationalement connecté au sein du domaine ETH (Instituts fédéraux suisses de technologie). Eawag mène des recherches, dispense des formations et offre des conseils d'experts afin d'atteindre les doubles objectifs de répondre aux besoins humains directs en eau et de maintenir la fonction et l'intégrité des écosystèmes aquatiques.
Le Département des eaux de surface - Recherche et gestion (
SURF
), à Dübendorf (ZH), propose un poste vacant pour un
Mémoire de master sur la reconstitution des communautés de bactéries méthanotrophes durant l'Holocène d'un lac alpin (h/f/d)
Contexte :
Les bactéries oxydant le méthane (MOB) jouent un rôle clé dans la régulation des émissions de méthane des lacs, mais la dynamique passée de leurs communautés sous des conditions environnementales et climatiques changeantes reste mal comprise. Notre groupe étudie les communautés de MOB dans les lacs alpins et péri-alpins en utilisant une combinaison d'analyse de biomarqueurs lipidiques et d'outils de biologie moléculaire. Nous recherchons actuellement un étudiant motivé en master pour appliquer cette approche à une carotte sédimentaire de 12 mètres prélevée dans le lac alpin de Taney (VS).
Description du projet :
Ce projet de MSc reconstruira la composition et la dynamique des communautés de MOB dans les sédiments du lac de Taney en utilisant des biomarqueurs lipidiques bactériens spécifiques appelés bactériophanépoyls (BHP), ainsi que des proxys complémentaires (par ex., TOC, abondances élémentaires XRF) et mettra ces résultats en relation avec l'évolution plus large de la biogéochimie du lac durant l'Holocène. Le groupe de sédimentologie fait partie du Département des eaux de surface et est dirigé par la Prof. Nathalie Dubois, cheffe du Département des eaux de surface. Le projet offre la possibilité de définir ensemble les questions de recherche spécifiques, en fonction des intérêts de l'étudiant.
Ce que vous ferez
• Traiter et sous-échantillonner la carotte sédimentaire du lac de Taney (~50 échantillons)
• Extraire et analyser les biomarqueurs lipidiques via UHPLC-Orbitrap-HRMS
• Effectuer l'extraction d'ADN et préparer les échantillons pour le séquençage des amplicons 16S rRNA
• Interpréter les données multi-proxys pour reconstruire la dynamique passée des communautés microbiennes
• Optionnellement participer à une campagne de terrain au lac Rotsee pour observer directement le processus complet de prélèvement de carottes en octobre 2026
Vous acquerrez
une expérience pratique en laboratoire couvrant une chaîne analytique complète allant de la géochimie organique à la biologie moléculaire. Vous aurez accès à des instruments de pointe à Eawag Dübendorf, notamment UHPLC-Orbitrap-HRMS, et bénéficierez d'une supervision étroite au sein d'un groupe de recherche actif.
Nous recherchons
un étudiant inscrit dans un programme de MSc à l'ETH en géosciences, sciences de l'environnement, biologie ou domaine connexe. Vous avez un intérêt pour la biogéochimie, la (paléo)limnologie et/ou l'écologie microbienne et êtes prêt à travailler avec diverses techniques analytiques. Aucune expérience préalable en spectrométrie de masse ou biologie moléculaire n'est requise.
Chez Eawag,
nous offrons un environnement de travail où des personnes aux expériences, forces et perspectives diverses peuvent pleinement contribuer et se développer. Ici, vous pouvez nous aider à progresser ! Nous favorisons une participation authentique, l'échange et la compréhension mutuelle. Nous créons des structures permettant la conciliation travail-vie personnelle, comme le travail de soins, et nous efforçons continuellement de réduire les barrières.
Avez-vous des exigences spécifiques concernant le processus de candidature ou le poste, ou avez-vous besoin d'informations supplémentaires ? Parlez-en avec nous - nous serons heureux de vous soutenir avec des solutions possibles de lieu de travail flexible, d'horaires et d'organisation du travail. Pour plus d'informations, veuillez consulter notre site web sur
Eawag
ainsi que nos
conditions
d'emploi.
Le projet est prévu pour commencer
au semestre d'automne 2026 avec la phase de proposition (si nécessaire, par ex. D-EAPS à l'ETH), suivie du projet au semestre de printemps 2027. La date de début exacte peut être discutée. La durée du projet est de 6 mois. Les superviseurs sont Lorenzo Cellino, doctorant, et Nora Richter, boursière SNSF Ambizione.
La date limite de candidature est le 30 octobre 2026 ou jusqu'à ce que le poste soit pourvu
et les candidatures seront donc évaluées au fur et à mesure. Les candidatures doivent inclure une lettre de motivation très courte (max. une page) décrivant vos intérêts et leur pertinence pour ce poste, ainsi qu'un CV.
Pour plus de détails sur le poste, veuillez contacter
Lorenzo Cellino
ou
Nora Richter
par email.
Nous attendons votre candidature avec impatience.
Veuillez la soumettre via cette page web, toute autre forme de candidature ne sera pas prise en compte. Un clic sur le lien ci-dessous vous mènera directement au formulaire de candidature.
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