NGS Scientist (single-cell and spaital Omics)

Pour notre client, une entreprise pharmaceutique de premier plan basée à Bâle, nous recherchons un scientifique NGS motivé-
Les technologies d'omics unicellulaires et spatiales transforment la recherche biomédicale en permettant une caractérisation approfondie des systèmes biologiques complexes avec une résolution sans précédent. Ces technologies fournissent des informations cruciales sur l'hétérogénéité cellulaire, les mécanismes des maladies, les réponses thérapeutiques et la biologie translationnelle.
Nous recherchons un scientifique / scientifique associé hautement motivé pour rejoindre une équipe de plateforme génomique de pointe axée sur le séquençage unicellulaire, la transcriptomique spatiale et les applications de séquençage de nouvelle génération (NGS). Le candidat retenu travaillera à l'interface de la biologie moléculaire, de la génomique et de la recherche translationnelle, soutenant le développement et la mise en œuvre de technologies omiques innovantes qui accélèrent la découverte scientifique et l'innovation thérapeutique.
Responsabilités clés
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Développer, optimiser et mettre en œuvre des flux de travail avancés basés sur le NGS avec un focus sur :
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Séquençage ARN unicellulaire (scRNA-seq)
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Transcriptomique spatiale
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Approches multi-omiques et multimodales
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Réaliser de manière autonome des expériences de biologie moléculaire et résoudre les problèmes complexes des flux de travail.
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Exécuter le traitement des échantillons, l'extraction des acides nucléiques, PCR/qPCR, préparation des bibliothèques, séquençage et activités de contrôle qualité.
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Générer, analyser et documenter les résultats expérimentaux avec un haut niveau de rigueur scientifique.
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Travailler avec des types d'échantillons difficiles, y compris les tissus FFPE, les échantillons primaires et les matériaux à faible entrée.
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Collaborer étroitement avec les équipes de bioinformatique et de recherche interfonctionnelles pour interpréter les jeux de données de séquençage et en tirer des informations biologiques.
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Assurer la génération de données de haute qualité, conformes aux principes FAIR.
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Présenter les résultats scientifiques, protocoles et recommandations aux parties prenantes internes.
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Contribuer à l'innovation continue et à l'amélioration des capacités de la plateforme.
Qualifications requises
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Master en biologie moléculaire, biotechnologie, biochimie, sciences de la vie, génomique ou discipline apparentée.
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1 à 3 ans d'expérience en industrie ou en recherche pertinente en génomique ou biologie moléculaire.
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Expérience pratique des flux de travail de séquençage de nouvelle génération (NGS).
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Solide expertise en :
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Extraction d'ADN/ARN
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PCR et qPCR
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Préparation de bibliothèques NGS
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Techniques de laboratoire de biologie moléculaire
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Expérience dans la manipulation d'échantillons cliniques ou biologiques difficiles tels que tissus FFPE, spécimens tumoraux ou échantillons à faible entrée.
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Capacité avérée à concevoir, exécuter, analyser et résoudre de manière autonome des expériences.
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Excellentes compétences en communication et capacité à collaborer efficacement au sein d'équipes pluridisciplinaires.
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Maîtrise de l'anglais.
Qualifications préférées
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Expérience pratique avec les plateformes de séquençage unicellulaire (ex. 10x Genomics Chromium).
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Expérience avec la transcriptomique spatiale et les technologies de biologie spatiale (ex. Visium, Xenium, CosMx, RNAscope).
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Connaissance des approches transcriptomiques, génomiques et multi-omiques.
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Expérience en développement d'essais, optimisation de méthodes et mise en œuvre technologique.
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Familiarité avec les analyses bioinformatiques de base et l'interprétation des jeux de données de séquençage.
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Expérience dans un environnement pharmaceutique, biotechnologique ou de recherche translationnelle.
Ce que nous recherchons
Nous sommes particulièrement intéressés par des candidats qui combinent une forte expertise en génomique de laboratoire humide avec une passion pour les technologies émergentes telles que le séquençage unicellulaire et la biologie spatiale. Les candidats retenus sont curieux, innovants, collaboratifs et enthousiastes à l'idée d'appliquer des technologies omiques de pointe pour faire progresser la recherche translationnelle et la découverte thérapeutique.