Stage post-diplôme « Analyse de données (génomique, protéomique) des bactéries stimulant la croissance des plantes »

Offre d'emploi : Stage post-diplôme « Analyse de données (génomique, protéomique) des bactéries stimulant la croissance des plantes » -- SIB Institut Suisse de Bioinformatique, Zurich.

Agroscope recherche un stagiaire post-diplôme en analyse de données à Wädenswil.
Tâches
•
Analyser les données de protéomique microbienne et les intégrer.
•
Assembler les génomes de bactéries à l'aide de données NGS.
•
Contribuer aux projets de recherche du groupe de génomique microbienne.
Compétences
•
Diplôme de Master récent en Bioinformatique ou Biologie Computationnelle.
•
Compétences en programmation (Python/R) requises.
•
Bonnes compétences en communication et esprit d'équipe.
Pour renforcer notre équipe à Wädenswil, Suisse, nous recherchons un(e)
Stage post-diplôme « Analyse de données (génomique, protéomique) des bactéries stimulant la croissance des plantes »
Description du poste
Agroscope est le centre d'excellence suisse pour la est a la recherche de en agriculture, nutrition et environnement. Nous avons une ouverture pour un(e) étudiant(e) post-diplôme motivé(e) à nous rallier DÈS QUE POSSIBLE.
Date de début : 1er juillet 2026 (ou selon accord)
Nous recherchons une personne dévouée qui aime analyser et intégrer des données de génomique fonctionnelle (principalement des séquences de génome et des données protéomiques, et éventuellement des données RNA-seq et Tn-seq) et qui peut nous aider à comprendre les mécanismes permettant aux bactéries de stimuler la croissance des plantes et, en outre, d'inhiber la croissance des agents pathogènes nuisibles aux plantes. Nous offrons un environnement diversifié et international, un fort esprit d'équipe, ainsi qu'une recherche pratique et innovante. Pour plus d'informations, veuillez contacter le Dr Christian Ahrens, chef d'équipe Microbial Genomics & Bioinformatics (Molecular Ecology Group, Agroscope) et chef de groupe à l'Institut Suisse de Bioinformatique SIB (
https://www.sib.swiss
/christian-ahrens-group/).
Tâches
•
Analyse des données protéomiques microbiennes ; intégration avec les informations génomiques
•
Assemblage du génome des bactéries à l'aide de données NGS (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore Technologies) et annotation du génome
•
Aide à l'analyse d'autres données OMICS (RNA-Seq, Tn-Seq)
•
Contribution aux projets de cherche (y compris publications) de l'équipe Microbial Genomics and Bioinformatics
•
Maintenance et extension des pipelines d'analyse de données (protéomique, assemblage de génome)
Profil requis
•
Master récemment obtenu (il y a moins de 10 mois) (ETH ou université, FH)
•
Scientifique motivé avec une formation/diplôme en bioinformatique/biologie computationnelle
•
Excellentes compétences en programmation (Python/R) ; expérience dans l'analyse de données de génomique fonctionnelle est un plus
•
Bon joueur d'équipe avec de bonnes compétences en communication
•
Connaissance (idéalement) de deux langues officielles suisses et très bonne maîtrise de l'anglais
Comment postuler
Si ce role stimulant et très intéressant vous intéresse, veuillez envoyer votre candidature incluant CV et lettre de motivation à :
christian.ahrens@agroscope.admin.ch

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